La selva Misionera alberga más de 2000 especies de plantas, desde árboles que impresionan por su tamaño como pinos, araucarias, cedros, lapachos con flores rosadas o blancas, hasta un grupo variado de orquídeas multicolores, claveles del aire y el Palo Rosa considerado Monumento Nacional. En Puerto Paraíso rodeando La Misión, podemos ver en las plantaciones de citronella, a los colonos recolectándola a corte de machete, traslandándola en carros tirados por bueyes para su posterior proceso en alambiques.